Al-Bahjah Bogor dibentuk dan direstui oleh Buya Yahya selaku Pembina Yayasan Al-Bahjah pada tahun 2017, dan sejak itu Al-Bahjah Bogor resmi menjadi cabang dari Yayasan Al-Bahjah yang berpusat di cirebon. Adapun struktur kepengurusan Yayasan Al-Bahjah Cabang Bogor diantaranya :
- Pembina Yayasan Al-Bahjah : Buya Yahya
- Dewan Pembina Yayasan Al-Bahjah Bogor :
- drh. Irman Facrudin
- drh. Dody Isuparmo
- dr. Muhammad Refi
- Hj. Husna Anwari
- Dewan Pengawas
- H Deni Afrianto
- H. Hanafi
- H Fauzan
- Lina
- Ketua Yayasan Al-Bahjah Bogor : Drh. Kukuh Galih Waskita
- Wakil Ketua Yayasan Al-Bahjah Bogor : Rifki Maulana S.Si
- Sekretaris : Eko Wahyudi P S.Pi
- Bendahara : Andika Tri Saputra S.Pi